蛋白质结构是生物分子研究的核心领域,因为它们的结构与功能密切相关。蛋白质结构通常分为四个层次:一级结构、二级结构、三级结构和四级结构。
图1
1、一级结构(Primary Structure):
(1)描述的是蛋白质的氨基酸序列。
(2)这一连续的氨基酸链是通过肽键连接的。
(3)一级结构决定了蛋白质的身份和许多其生物学性质。
(4)测定方法:
氨基酸测序:例如Edman降解法,可以连续地从蛋白质的一端切割并识别氨基酸。
质谱分析:特别是串联质谱,可以用于识别和测定氨基酸序列。
2、二级结构(Secondary Structure):
(1)描述的是蛋白质局部的折叠模式,例如α-螺旋和β-折叠。
(2)由氢键引起的局部稳定结构,氢键是在氨基酸的主链之间形成的。
(3)这些模式为蛋白质的三维结构提供了框架。
(4)测定方法:
圆二色光谱(CD):用于检测蛋白质中α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲的内容。
红外光谱(IR):可以用于分析蛋白质的二级结构。
3、三级结构(Tertiary Structure):
(1)描述的是单个多肽链完整的三维结构。
(2)三级结构是由于氨基酸的R基团之间的相互作用(如疏水作用、离子键、氢键和二硫键)引起的折叠。
(3)描述了蛋白质的整体空间排列。
(4)测定方法:
X射线晶体学:分析纯化并结晶化的蛋白质样品,获得蛋白质的高分辨率三维结构。
核磁共振(NMR)光谱:在液态条件下获得蛋白质的三维结构信息。
冷冻电镜(Cryo-EM):用于获得大分子复合物的三维结构。
4、四级结构(Quaternary Structure):
(1)描述的是多个多肽链(亚单位)如何聚集形成完整的蛋白质复合体。
(2)不是所有的蛋白质都有四级结构。只有由两个或更多的多肽链组成的蛋白质才有。例如:血红蛋白由4个多肽链组成。
(3)测定方法
X射线晶体学和冷冻电镜:都可以用来分析大分子复合物的结构。
凝胶过滤色谱和亲和色谱:可以用于确定亚基之间的相互作用和组装。
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